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始于平安时期的“源氏长者”通常由源氏一族中最高位者担任，是源氏一族名义上的领袖，拥有总领一族祭祀、招集和裁判等特权。
最开始是由嵯峨源氏担任，初代长者是左大臣源信，元庆五年（公元八八一年）源氏长者开始兼任淳和、奖学两院别当之职。后来，源氏长者为村上源氏独占，自源师房和源雅定后，由出自村上源氏的久我、堀川、土御门、中院家垄断。后来，堀川、土御门、六条诸家断绝，中院家苟延残喘，源氏长者之位为久我家独占。
武家源氏出任源氏长者，始自足利义满，其后有义持、义教、义政、义稙以及虽未受长者宣下但实际上担任了淳和、奖学两院别当的足利义尚共计六人。战国时期，源氏长者回到了村上源氏久我家手中，其他的源氏系被排除在外。但久我通坚于天正三年（公元一五七五年）去世后，这一称号便一直空缺，至今已经有二十七年了。这段时间与所谓的“安土桃山时代”大致相符，也从一个侧面反映了织田信长和丰臣秀吉不同于足利氏的征伐天下之路。
如今秀保重拾这一称号，看上去是走回了老路，但实际上却是走了一条“第三道路”，既一定程度上恢复了传统，缓和公武矛盾、争取传统大名的支持，又保持了自己丰臣氏的名分，避免丰臣氏离心离德，算是当时最为优化的一种方案。
既然敲定，便要尽快付诸实施。庆长七年腊月十八，离新年朝觐秀赖还有些日子，但按照惯例，全国的大名也都提前到达位于大坂和伏见的屋敷，互相拜访，互通有无。就在这天，应秀保之邀，各路大名齐聚伏见，出席秀保主持的茶会。
就在觥筹交错、氛围正酣之时，秀保故作随意地对席中的石田三成笑道：“听闻治部是最早上洛的大名，此番应该也是觐见过少主了，是不是也该放心了？”
“殿下此话何意？”石田三成故作不解地笑道。
“怎么，前段时间你们几位大人刚联名上书，这么快就忘了？”秀保反问道。
“这……”石田三成一时语噎，两人的对话也引起了在座大名的注意，多有等着看石田三成笑话的意思。
这时，一旁的增田长盛出来打抱不平了：“殿下，请恕在下直言，若没有那次上书，吾等今日有机会坐在此处么？”他的这句话可谓是正中秀保下怀。
“看来各位对在下还是颇有偏见啊。”说着，秀保拍了拍手，殿内的歌舞伎见此随即退了出去。
“诸位，临近年关，本想着借此机会大家开怀畅饮，纵情欢乐的。可肚子里还是憋着一股话不得不说。”秀保说罢，叹了口气。
“殿下有话直说好了，不必顾忌。”加藤清正朝石田三成等人瞪了一眼，忿忿不平道。
“那在下就开门见山了，”秀保说道，“早先沸沸扬扬的所谓‘七臣上书’，诸位也都知道了，如今几位大人也都在场，我想着有些话要说明白。虽说话里话外毫不客气，但我相信都是为了丰臣氏着想，该说的我已然给诸位回信说明了，可仁又卫门方才的话还是包含满满的不信，既然如此，那在下不得不出此策了。”
“为避免所谓“曲沃代翼”“下克上”之类的担忧，维护丰臣氏的威信，在下决定将苗字改回“三好”，以表自己绝无篡夺关白之意。”
秀保此言一出，震惊四座，就连刚才一脸不悦的增田长盛也大为惊讶，在座众人纷纷出言相劝，就连片桐且元也是坚决反对。面对一头雾水的石田三成，片桐且元窃声道：“你觉得这是好事么，原本他是被丰臣氏拴住的一匹马，这下好了，缰绳解开了，你们以为他就会跑得远远的？我看未必，怕是失去控制后，一不做二不休，直接将丰臣氏和吾等踢翻在地啊！”
“这可如何是好？！”正当石田三成手足无措之时，小笠原忠清和藤堂高虎，相继“进入角色”，开始了预先安排好的表演。这一过程看着跟真的似的，可明眼人都知道这不过是在演戏。
具体过程无需多说，无非就是在众目睽睽下表明了这样一个结果：将三好氏的源流，从河内源氏义光流之庶流小笠原氏，更正为河内源氏义忠流嫡流稲沢氏。
这场戏，不少大名听得云里雾里，直到最后时刻，方才恍然大悟。
“左府这是想占据河内源氏嫡流啊。”已然看透的片桐且元感慨道，“我们之前想的还是太简单了，他的野心远超我们想象。”
“他这么一弄，河内源氏嫡流就不再是源为义一脉了，更是和源义国一脉沾不上边了，也就是说，镰仓、室町幕府的正统性在一定程度上被他否定了，河内源氏的《尊卑分脉》要被他改写了……”对此颇有研究的增田长盛感叹道。
“父系是河内源氏嫡流，母系和养父一系是丰臣氏，这……”弄巧成拙，这让石田三成颇为懊悔。
“这还不是最主要的，左府现如今认下了这个血统，但是‘念及本姓、苗字乃太阁和大纳言所赐，不敢更改’，也就是说，他在不改变丰臣氏身份的情况下，还认下了河内源氏嫡流的身份。如此一来，今后想拉近和公卿的关系就称丰臣氏，想与武家大名亲近就称源氏，真的是‘左右逢源’啊。”片桐且元叹了长长一口气。
可事已至此又能怎样呢？至少秀保表面上明确了自己出自源氏的身份，在外人看来，也算是消除了一些丰臣旧臣的疑虑吧。况且这一切皆起于“七臣上书”，再这般咄咄逼人，只会加剧与秀保的矛盾，更有甚者可能成为某些大名手中的枪，不明不白地成为替死鬼。
于是乎，在异常沉寂的气氛中，秀保完成了家格的转变，菊亭晴季等人也随即开始运作。庆长八年三月初三（1603年），朝廷正式颁布敕令，敕封秀保为源氏长者，充淳和、奖学两院别当，为后续开幕奠定了基础。八月初，朝廷欲派遣使者前往伏见进行征夷大将军宣下，为与“安土桃山时代”割裂，经秀保恳请，朝廷遂于十五日改往郡山城宣旨，同时令秀保兼任右近卫大将、右马寮御监。
至此，秀保以“正二位左大臣右近卫大将征夷大将军右马寮御监淳和、奖学两院别当源氏长者”的身份和地位在郡山开幕，该幕府史称“郡山幕府”，也有人称之为“河内幕府”或“羽柴幕府”。虽于郡山开幕，但秀保仍在伏见处理政务，而由嫡子坐镇郡山；全国大名闻讯纷纷前来朝贺，石田三成未曾想自己竟然促成秀保成为武家栋梁，无奈之下只好称病派遣嫡子前去道贺。这一年，秀保在全国范围内再次进行检地，全国石高从庆长三年太阁检地时的一千八百万更正为两千两百万。